1. 学术质量不高
旧金山州立大学作为一个公立大学，在学术水平上相对于一些私立大学还是有所欠缺的。这也是旧金山州立大学排名一直不够理想的一个重要原因。学术水平的提升需要大量的投入和时间，但是目前来看，旧金山州立大学在学术方面的投入仍然不够，导致学术成果不如人意，排名也跟着下降。
2. 进行过多创新实践项目
旧金山州立大学在近几年进行了大量的创新实践项目，包括开设新专业、推出新的研究计划等。这些项目不仅需要大量的经费投入，还需要为这些项目招聘符合要求的教授和研究人员。这些创新实践项目走向职场更具现实意义，但是对于学术排名的影响不容忽视。由于项目时间紧、任务重，有时可能会影响学术水平的提高，影响了旧金山州立大学的综合竞争力。
3. 缺乏国际化人才
与一些名校相比，旧金山州立大学相关的科研和教学团队组织架构面对缺乏国际化、国际背景和专业技能的人才。一些国际化学术交流和合作的机会也因此被忽略。与此同时，旧金山州立大学也失去了一些有价值的机会来提高学术水平、提升大学的全球化程度。这也是旧金山州立大学排名一直低于其他大学的原因之一。
4. 资金不足
旧金山州立大学属于美国公立高等教育系统，从一定程度上受到了财政预算的限制。在经费受到限制的情况下，旧金山州立大学仍在承担大规模的教学、科研任务以及不计其数的创新实践项目等。这对旧金山州立大学的学术和教育质量、装备设施等各方面都带来了一定的挑战。因为资金不足，旧金山州立大学无法吸引到更多的优秀教授和国际研究人员，并且无法提供更好的学术设施和科研设备，致使学校不能够达到预期的学术水平。
