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1985年更名为上海第二医学院大学。1997年，学校通过了“211工程”项目。2005年7月，上海-1 大学与上海第二医学院大学合并，教育部和上海市政府共建的新上海-2成立。2010年11月，学院成为卫生部和教育部首批共建的十所重点大学之一。
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