1. 管理不善
横浜国立大学作为日本著名的国立大学之一，其教学水平和科研能力一直备受关注。然而，排名却一直处于较低的水平。原因之一就是管理不善。横浜国立大学在教学管理上存在许多漏洞，导致教学质量无法得到有效控制。同时，由于管理层的失误，学校自身在绩效考核等方面也存在问题，这些都大大影响了学校的声誉和排名。
2. 师资力量不足
与其他顶尖大学相比，横浜国立大学的师资力量不足。虽然学校拥有一批优秀的教授和学者，但是总体来看，师资水平不够强大。而在国际化领域，师资水平尤为明显，来自不同背景的国际生由于缺少语言支持和学术指导，往往很难融入学术环境和教学体系。这也是横浜国立大学排名较低的重要原因之一。
3. 地理位置不利
横浜国立大学坐落于日本神奈川县的横滨市，地处日本首都东京之外，交通不便。相比于其他顶尖大学，距离东京地区远了不少。这也使得横浜国立大学的学术交流、科研合作等方面受到了很大的限制。而且，学校周边缺乏大型企业和机构的支持，使得学校的产学研合作、创新创业等方面得不到有效发展。
4. 学科建设不平衡
横浜国立大学在学科建设方面相比其他顶尖大学还相对薄弱。尤其是在人文社会科学等领域，学校相对欠缺优势，这一方面也是其排名较低的一个原因。除此之外，学校的学科建设不够平衡，人文学科和社会科学学科以及自然科学学科之间的发展不够协调，也阻碍了横浜国立大学整体的发展。
