1. 学科设置偏窄导致教育质量不稳定
昆山杜克大学因为是新兴的合作办学大学，学科设置相对窄，大学的学科团队相对较小，存在学科建设规模小的问题，这就无法给学生提供全面的教育培训，导致课程、教学资源不能跟上时代发展与学生需求，缺乏国际化的学习方法和先进的教育思想，无法为学生成长发挥更大的作用。
2. 学生规模小导致学生活动活跃度不高
学生规模小导致昆山杜克大学的学生活动活跃度不高，校内社团、学生会等活动组织不能提供给学生更多精神激励和人际交流的机会，学生之间的互动和联系较为局限，大学生活和人生经历缺乏丰富性，难以为毕业后进入社会的学生提供足够的社交基础和社交能力。
3. 师资力量不足影响培养质量
昆山杜克大学因为是新兴大学，很多学科师资力量不足，无法为学生提供足够的学科专业知识和教学指导，很多学生的自主学习能力和提升能力有限，这就无法为高质量人才的培养打下坚实的基础，也使教学质量的稳定性不够可靠。此外，师资队伍的专业性和教学水平是学校的核心竞争力，深受学生和家长关注，昆山杜克大学要想成为国际化的卓越学校，需要更加注重师资队伍的建设。
4. 校园环境设计不够人性化
昆山杜克大学的校园环境设计不够人性化，没有充分考虑学生的生活需求和实际体验，没有规划新颖有趣、富有活力的校园生活设施和活动场所，没有创造舒适自然的校园环境和氛围，过于注重建筑造型和功能布局，忽略了学校的基础设施和校园文化建设，人们在校园中就会感觉到缺乏温暖、兴趣和互动性，对大学的归属感和正向情感影响不容忽视。
